もとよりPCIeがケーブルで引き回すようには設計されていないからです。
ことにPCIe-4.0で転送速度がかなり上がり、ノイズや減衰の影響をかなり受けやすくなっています。
3.0で稼働する環境でも4.0で駆動させるとフリーズすることもままあるようです。
現状で転送速度は十分足りているのであえてリスクを冒すメリットはないのでしょう。