船内の入出力は全く別々のものが二系統あるのよ

・キャビン直結系
　宇宙旅行モジュールに外から直接接続できる液体気体の入出力ポートに流し込むと
キャビン内の天井とか床に最初からある入出力ポートとやりとりできる
　宇宙空間でキャビン内の入力ポートに流し込むと、宇宙に捨てられる
　貨物モジュールは通らない

・貨物モジュール系
　発射台の真横に液体・気体のポートローダー(という設備)を建ててそこにパイプを接続すると、貨物モジュールとやりとりできる
　キャビン内に入出力端子(最初からあるものとは別)を作り、そこにパイプを繋ぐと、貨物モジュールの中身とやりとりできる