【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]
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理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。
奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。
さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html 富嶽で使われるARMは、AmazonのAWSにも使われているよ。 でも明日の天気すら当たらないんだろ。
アホみたいに被害も出てるし何の役にも立たない。 新薬ができるのは早くて2,3年だろうね。
順調に行けば５年ってとこ
それまでは代用品でだな 税金で飯食ってる世界中の二重国籍者の分析をお願いいたします で、実際の医療現場で薬使えるようになるのはいつなんだい？ これも結局一年もするとアメリカに簡単に抜かれるだろう
ＧＰＧＰＵだとこの半分の予算で倍の性能になる >>1
富岳って対コロナ用に前倒しで実戦配備されたんだよな
ガンダムみたいだな ガンガレ！ いや１種類を選別するならまだしも2000種ってどでもいいだろ >>32
京が1年掛かる計算を数日でできるらしいからな
21年始動を1年近く前倒ししたとか浪漫すぎる １種類でも年単位で試験するのに２０００種類も試験してたら
いつ出来るのやら。
２位のスパコンで良いんじゃね？ >>36
絞ってるぞ
トップ10くらい以外はゴミみたいな効果しかなさそーって
グラフがあったしそれミロ 凄えな富嶽。この調子であと一カ月もすれば、
どんな薬でもコロナに効くことが判明するのでは？ ウンコを入れればウンコが出てくる
それがデータサイエンス
そんな方法で今までどんだけ失敗してきたか
スパコンになっても手法が糞なら糞しか出ないね 別に富岳じゃないとできないわけじゃないんじゃないの？ >>40
i7のＣＰＵ一個でも可能だが何万年もかかるというわけ 他国のスパコンだってその位やってるだろう
ぶっちぎりの1位でもないのに >>1
俺なら2000どころか、もっと挙げてみせるぜ
10倍くらいいけるな >>45
今はぶっちぎりの一位
そして4種類のベンチマーク全てでの一位（4冠）は史上初 富岳チューニングするための丁度良いデータ取りになるからこいつじゃないと意味ないだろうし
ガンガン使って使い勝手上げてほしいものだね >>5
判定対象が数千種類あって、それを10日で処理したんだろ
なるべく多くを短時間で処理できた方がよかろうよ >>46
そこから可能性ありと抽出されたのは数十種 >>14
ワイコンピュータの計算によると2120年7月1日の時点で生存確率0.001%や スパコンより量子コンピューター使ったほうが良くないの？ どえらい投資をしてるんだから
「ワクチンの100や200位」見つけ出すだろう
一日も早く先んじて元を取り返すんだな！ >>9
grapeは専用命令を追加したプロセッサだったような。ただ並列度はわからん。
以前にEDAベンダーのセミナーで発表があった。いわゆる「当社のツールを使ってプロセッサを開発しました」っていう内容で。
もっとも、スパコンとなると並列度が全然違うからな。 >>5
そこから似た成分で分類とかしていけばもっと減らせるだろ。
もっと考えろ。 >>52
2千台（以上）のワークステーションで処理した方が速いはあるかも 選ぶのではなく、あたらしくコロナにあった薬をつくる事は出来ないの？ ２０００ってふざけて居るのか、
２個とは言わないが、せめて２０個に絞り込めよ >>57
減らした物を提示してくれよ。
贅沢を言うなら、1番効くのはこれだ！と教えて欲しいがｗ あくまでシュミレーション上の結果だから良さそうなシャブを実際に使っても全然クソってのもありうる
全部治験してからの話でしかない
そんなんしてる間に変異するから厄介だしな >>1
俺なら何億種類でも候補に出来るぞ、スパコン超えたな。 ホンダＦ1制覇の日々
充実してたなあ
JAXAのはやぶさ2と富岳とで
戻ってくりゅ？ でも、アビガンの承認は当分ありません。
日本は、スパコンや全自動PCR検査機が作れても、活かせない。 しかしスパコンの性能が凄くなっても世の中良くならないもんだな。 >>1
なんだ、スパコンのくせに10日もかかって候補だけかw >>1
富岳の開発費用は1100億円だろう？、
きっと2000億円くらいで売れるよ >>1
でも、選別結果の実証は、人体実験でやるンですね。 おきらく、ごきらく〜。 >>7
あの辺は製薬会社の研究所がいっぱいあったね >>1
２０００の中にはサトウの水虫薬とか大正製薬のリアップも入ってるのかな？ 2000は多いな
ここからどうやって効果がありそうなやつを絞っていくんだ？ フロンティオがやばいな
富岳より先にAIを活用して既存の薬からコロナに効果ある薬を選別する事業始めてたのに
明日暴落不可避 >>40
別に富岳でなくてもできる
上場企業がすでに同じことしてるし
ただ処理能力高いから他よりもはやくできる 陰キャから嫌われるのは確かだがこういうのは実際には陽キャ特有の潤沢な行動回数使って片手間でも色んな作品見てイベントとか行って「オタク」ってアイデンティティーにすがるしかないそこいらの無気力陰キャよりはオタクやれてるんだよなぁ 今日本にある承認済みの薬剤を、標的のタンパク化合物にどう作用するかのシミュレーションできるソフトが、とっくの昔に完成していたのが驚き。 いま臨床試験とかやってる薬の効果確認に先に使えよって思うけど よくわからんけど
シミュレーションソフト作る人もすごくない？ >>24
富岳たんが使うわけじゃないから、適当かと。 暫くはコロナ薬開発専用機として使った方が世の中の為になるだろうからそれで行って欲しいな。 韓中米はすでに量子コンピュータ競争なのに日本はいつも周回遅れだね。 2000は既知の組成解析済みで、そういう薬のデータベースに登録されているものですよね。
その2000の薬に対して、物理的に、原子的に新型コロナとくっつきやすいものを、分子動力学計算を使って、数個選び出したと言っているのかと。 すごいかどうかは、最良なものを洩らず選別できていたかがわかってからでしょ。
むやみやたらとホルホルやってるほんとあの国みたいでみじめ なるほど！
こういう事が出来る事が蓮舫的には嫌だったのねｗ >>5
新薬開発の話なんだから
２０００種類なんぞ多くもなんともねぇぞ
昔は、数万種に及ぶ候補を手作業してたんだから。
今の創薬なんて、お任せモードみたいなもんだよ。 >>109
嫌も何も、チューニングだろ
そんなの２位でも別にできるけどな。
やることが別段変わる訳じゃないからｗ バカウヨ：選別したんだ、すごーい！！！
普通の人：間違いなく選別できたのならすごいね
でもそれはまだわからないね
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