【IT】スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別 [田杉山脈★]
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理化学研究所(理研)は、スーパーコンピュータ「富岳」を活用し、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となりうる数十種類の物質を発見したと発表した。7月3日、オンラインで開催した「新型コロナウイルスの治療薬候補同定」の中間報告のなかで、理化学研究所 科技ハブ産連本部医科学イノベーションハブ推進プログム副プログラムディレクターであり、京都大学大学院医学研究科教授の奥野恭史氏が明らかにした。
奥野教授は、「1つの標的タンパク質に対するすべての薬剤での評価が終了し、興味深い結果が出た。残り3つの標的タンパク質においても同様の評価をしたい」とする一方、「数千規模の化合物とタンパク質の作用(結合)過程を、分子動力学計算レベルで計算した事例は世界でもはじめてであり、学術的にインパクトがある」と発言。
さらに、「今回の結合シミュレーションには約10日間を要したが、ソフトウェアのチューニングが富岳用にできていないかたちで実施したものである。チューニングができれば、将来的には2日程度で計算が完了すると考えている。1週間あれば、1万以上の薬剤が評価できるようになり、創薬の世界を大きく変えることができる」と述べた。
以下ソース
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html 2000は既知の組成解析済みで、そういう薬のデータベースに登録されているものですよね。
その2000の薬に対して、物理的に、原子的に新型コロナとくっつきやすいものを、分子動力学計算を使って、数個選び出したと言っているのかと。 すごいかどうかは、最良なものを洩らず選別できていたかがわかってからでしょ。
むやみやたらとホルホルやってるほんとあの国みたいでみじめ なるほど！
こういう事が出来る事が蓮舫的には嫌だったのねｗ >>5
新薬開発の話なんだから
２０００種類なんぞ多くもなんともねぇぞ
昔は、数万種に及ぶ候補を手作業してたんだから。
今の創薬なんて、お任せモードみたいなもんだよ。 >>109
嫌も何も、チューニングだろ
そんなの２位でも別にできるけどな。
やることが別段変わる訳じゃないからｗ バカウヨ：選別したんだ、すごーい！！！
普通の人：間違いなく選別できたのならすごいね
でもそれはまだわからないね
この違いｗｗｗ せっかく見つけても、厚労省は利権・天下りにつながる治療薬しか認可しません >>41
複垢して大量のやられ役作って倒してけばものすごい強くならんか？ STAP細亡の 候補も
あっという間に2000個くらい
リストアップしたという >>119
多剤併用は複雑化しますんでｗ
種類が少ないに越したことはないですｗ 低能だろそんな無駄なことに
何千億つっこんでないで
アビガンはよ承認しろよ すごい wonderful 快挙
世界no1ですからね
二番ではだめですね 人工人間を電脳空間上で治験できるとかなら別だろうけど
結局ただのおもちゃ 蓮舫や反日議員たちは、日本の力を減衰させるのが仕事なんだよ
中国共産党の命令でね >>123 アビガンなんて何も効き目はないんだから、諦めろ。アホラシ。
イベルメクチンしかないよ。 >>127
IR誘致で中華企業から献金受けてた反日政治家がいましたね >>130
お前のは人間以外の生き物か？
中国、ロシア、インドetcで
アビガン一押しで開発しとるわ
人間以外の生き物なら
人間が天敵なので
アビガン承認したくない
気持ちもわかるわ >>123
そんな胡散臭い薬承認されても低能しか使わないよ >>125
こういう用途に使える汎用性が国策スパコンの条件になったのは、蓮舫の事業仕分けがきっかけなんだけど？ >>134 蓮舫さえ居なければ今頃倍の性能のスパコンを作れてたのにな。 世界中でスパコン作れるのは、日米2カ国しかないから
負けても2位なんだよな >>139
あと、中国。
米中は、同時に2〜3台開発できる力があるので、２位とは限らない。
LinpackベンチマークのTop500は、すぐに抜かれるかもしれないが、四冠同時にトップを取るマシンが次にすぐに出てこれるか、注目に値する。 治験にはカネも時間もかかるのに、２０００種類とかバカかとｗ
ズバリの物を出してこなかったら意味がない
せいぜい１０種類にまで厳選する能力がなければな
（スパコンが２０００種類の治験をやれと人間に要求するのかよｗ何様ｗ）
ハッキリ言って、スパコンで「ヘタな鉄砲数うちゃ当たるかも？」レベルじゃ
お話にならない カネの無駄
スパコンで治験しろよｗと言いたくなるわ ああ、副作用の可能性もスパコンで予測するんだぞ？
その程度できないようでは、膨大な電力かけてまでやる意味がない >>141
2000種類に絞ったんじゃなくて、2000種類の中から数十種類に絞ったんだよ >>139
来年にはアメリカ様に何倍もブチ抜かれる
日本
富岳 ARM 400ペタ 富士通製 2020年
アメリカ
Aurora x86 1000ペタ インテル製 2021年
Frontier x86 1500ペタ AMD製 2021年
El Capitan x86 2000ペタ AMD製 2023年 >>39
この場合については良く分からないが
少なくとも個人消費データについては同意する いくら候補が見つかってもアビガンと同じ運命なんだろ >>143
数十・・・ｗ 十数じゃなくてかｗ
まだ多いわｗ
危機のさなかに、そんな数を提案されてもどうすんのかとｗ
治験にかかる日数度外視してんのかね？
当るも八卦、当たらぬも八卦かよｗ
当った頃には人口激減、世界経済規模大シュリンクで文明維持もままならぬかもな
（スパコンも死ぬｗ） スパコンの中で仮想的に人体モデル作って感染させて
その治療薬候補ってのを投与して治験させろよｗ
今のスパコンは計算速度が速いだけで予め与えられたファクターに基づいて
ピックアップしてるだけじゃねーかｗ
治験に膨大な時間がかかるんだから、その間に時間かけてオタクのラップトップで
ちまちまリストアップしても一緒ｗ
開発に数千億円かける意味あんの？ｗ
いやスパコン目的は新薬候補探すことじゃなくて円周率計算することですからｗｗｗｗてか？
それとも投入額がまだ足りないのか？使えるまで１兆円？1京円？
無駄なことだな・・ｗ >>149
そんな話なら、日本中のラップトップで、分担して与えられた範囲の中から
計算すればいいってことになるんだが？
数千億円投資の意味あんの？
日本スゲーって勝ち誇って余韻に浸るだけで数千億円と、瞬間的に膨大な電力使うのに見合ってるか？
経済合理性がないよな・・ｗ ここＢＩＺだから世界のパソコン年間出荷台数知ってるよなぁ？
年間２億〜３億台が出荷される（スマホなども加えたデバイスでいえば２３億台）わけだが、既存のパソコンも加えて
新薬候補を分担して、与えられたファクターに基づいて計算するだけのことが
できないとでも？ｗ
笑かすわｗ その2000の中から２〜３種類に絞らないと意味ないじゃん馬鹿なの富岳って どうせ富士通にとって都合がいい選別基準なんでしょｗ 田宮さん：犯人は「内部、もしくは外部の者の犯行」
「犯人は男性といわれているが、女性である可能性も否定できない」
富岳：コロナ治療薬は「この中のどれか、もしくはその他」
「治療薬は絞り込んでいいるが、絞り込めていない可能性も否定できない」
ホルホルバカ：すごーい！！！
ホルホルやってるやつらってほんと恥ずかしいよなｗ どんな生き方してきたら富士通製のスパコンを信用できるんだろう… 村井ワクチンは効く、
アビガンは効く、
どちらも認証しない 絞り込むのか、さらに範囲を広げるのかどっちだろう？ 計算つか、膨大な資料から特定の単語を拾って検索してるだけじゃね・・・ｗ
数千億円かけて計算以下の仕事でジコマンか？ ここだけの話だけど
スパコンで人間は年内に絶滅すると計算されたらしいね >>1
大戦略IIの１ターンがどのぐらいで終わるのか
試させてほしい >>140 GPU方式ではGraph500 は無理だよ。
Graph500 とHPCG500 はしばらく抜かれないだろう。 >>155 馬鹿は黙っとれ、薬というのはいろんな効果があるから1種類で万粕\薬なんて存在ｂｹん。
熱さまし、ウイルスを殺す、ウイルスの侵入を防止する、ウイルスが増えるのを防ぐ、血栓防止、肺炎防止、サイトカイン暴走防止、、、、免疫強化
これらだけでも何十となる。 ちょっとずれた話かもしれんけど、むかしむかし、世界中の人たちのPCに協力してもらって
ガン治療の成果を出そうとかってなかったっけか？
ああいうの今でもやってんの？ これ自体はいい事だが、2位でもできることだな
使い勝手の方が大事だろ
その点で富嶽は優れてるんだろうが
富嶽の結果で京が正しかったって言う理屈がわからん 10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別
富岳じゃなきゃってほどでもないね 2000種類からどう絞り込むんだろ？
コロナ感染のラットに投与->健康な人間に投与->コロナ感染の人間に投与 かな？ >>5
2000を更に優劣付けられないととても試験まで進めないな… (´・ω・｀)もう絞り込んでいるそうな、特許切れてる薬とか数種類候補があって
今発表すると大変な騒ぎになるから発表を控えているけど、国内の某有名製薬会社と共同研究をするらしい
数ヶ月のうちに、その某製薬会社の株価が暴騰するから、楽しみにみててみ >>18
いや既存薬の転用だからほぼ薬効の確認
だけだからそんなに時間はかからない。 >>173 やってるよ。 昔は俺も参加してたことあったけど今は参加していない。 >>178 何をトンチンカンな事を言ってるんだ。
新型コロナウイルスが居るところに、既存薬の成分分子を漂わせて結びつくかはねつけるかなどの具体的な動きで判別してるんだよ。 常に動態観察。
その結果有効な組み合わせが数十種類見つかったと言う話。
これからそれらの治験を始める。 治験は動物なり人間なりを対象としないとコンピュータではまだ無理。 >>182 アビガンの治験にどれだけかかってるか知らないのか？ 半年1年は優にかかるよ。
BCGだって半年では難しい。 よし、それじゃあ古い京への餞別も
選別してもらおうか！！！ >>7
もういっそ、
「コンピュータ前」
にしとけばいつまでも使えるだろ。 たくさん選ぶならねらーでもできるから
そこから絞ってくれ 生aviからmp4へのエンコードに15分くらいかかるんだけど
0.1秒でできそう コンピュータがどれだけ進化しても
治験は生身の人間に時間ごとどんな変化が起こるかの臨床だからここの時間は縮まらない どういう計算をすればこんなことまでわかるのか、
全然わからん >>31
この記事は完全に支離滅裂。
数千個の中から2000個を同定したのではなくて
2000個の薬物の中からウィルスとして効果のある数種類の薬物を同定する作業を
これから始めると理研は発表している。
https://www.riken.jp/medialibrary/riken/pr/news/2020/20200407_1/t_20200407_1_p.pdf ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
