起動構成が消えるんじゃなくて、どうやら読み込めてないらしい

マイクラフォルダにあるjsonファイルの名前を
launcher_profiles.json
↓
launcher_profiles_microsoft_store.json
にリネームすることで起動できる様になるらしい

ただ、現状は旧ランチャーで起動すれば問題ないとのこと