ははは、また間違ってるわw
Jane2ch.brd の書き換えは、JaneStyleを閉じる必要があったね。

三度目の正直（順序も若干変更）

1　JaneStyleを起動させる
2　ボード一覧取得URLを "https://menu.2ch.net/bbsmenu.html"; に変更する
　（"http://menu.2ch.net/bbsmenu.html"; でもいいけど、後で元にもどすので、5→2だけでおk）
3　板一覧を更新すると、Jane2ch.brdが生成される

4　JaneStyleを一旦終了
5　3で生成された Jane2ch.brd について、エディタなどで "2ch.net" をすべて "5ch.net" に置換する
6　Logs\2ch にある bbsmenu.dat と bbsmenu.idx を削除

7　JaneStyleを再度起動させる
8　2で変更したボード一覧取得URLを元の "https://menu.5ch.net/bbsmenu.html"; にもどす
9　板一覧を再び更新する

今度は間違えてないと思う