>>970,973
> インストール時に自動的に作られたMy Macrosに入れています。

数年ぶりにMery本体を（あるいはPC／OSを）更新したとか
古いMeryのフォルダからMy Macroをフォルダをコピペしたとかでしょ？

もしそうならフォルダ名をMacrosに変えなくちゃならないし
includeライブラリを参照しているマクロは更新が必要

更新履歴より
▼ 2015/12/24 (2.4.7.6369)
> "My Macros"フォルダを"Macros"フォルダに名称変更。それに伴い、#includeの
> パスを"Macros"フォルダからの相対パスに変更。ついでに#iconのパスをマクロ
> ファイルからの相対パス、"Macros"フォルダからの相対パスに対応。

設定ファイルMery.iniはインストールしたフォルダにあるか、アドレスバーに %appdata%\Mery と入力して移動すれば見つかるはず
タスクトレイに常駐しているMeryを終了させて、Mery.iniをMery以外のエディタで開き
[Macros\Macro0] セクション以降に書き込まれたマクロのパスを確認
FileName=Macros\マクロ名.js
のようにMeryフォルダからの相対パスに書き直す

設定を全部まっさらからやりなおしたほうがいいんじゃないかな？