【医学】コロナ薬候補を数十種類 スパコン「富岳」で京大発見 [しじみ★]
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京都大学の奥野恭史教授らは3日、世界最高の計算速度を誇る理化学研究所のスーパーコンピューター「富岳（ふがく）」を用い、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となる物質を数十種類発見したと発表した。細胞内でウイルスの増殖を妨げる可能性がある。今後は細胞を使った実験などで効果を確かめる方針だ
理研副プログラムディレクターを務める奥野教授らは、富岳の高い計算力を使い、既存の薬剤2000種類以上を対象にシミュレーション（模擬実験）を実施した。ウイルスの増殖に関係するたんぱく質にくっつき、その働きを妨げる効果がどの程度あるかを調べた。
この結果、治療薬として有望だと考えられる数十種類を絞り込むことができた。この中には、新型コロナ向けに世界で臨床試験（治験）が進む薬剤が12種含まれていた。いずれも寄生虫の薬である「ニクロサミド」や「ニタゾキサニド」などで、ニタゾキサニドは既に米国やメキシコで治験が進行中だ。
また、日本の製薬会社が特許を持っている物質も、シミュレーションではよい結果が出たという。奥野教授は「富岳の計算でリストアップした中に、治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している」と話す。
今後は細胞を使った実験で、薬剤の効果を詳しく調べる。製薬会社や研究者と協力し、臨床研究や治験についても検討する考えだ。
富岳はスパコンの計算速度を競う世界ランキング「トップ500」で6月に首位となった。2011年に首位だった「京（けい）」が1年かかる計算を数日でできる計算能力をもつ。当初、21年から運用する予定だったが、新型コロナ研究のために今年4月に前倒しで使い始めた。
https://blogimg.goo.ne.jp/user_image/35/52/0948613f72d7c41464d1cdd16a3e5422.png
日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXMZO61137980T00C20A7EA5000/ >>1
これだけでもすごい実績になる
スパコンはすごい はよ駅名を京コンピューター前駅から富嶽コンピューター前駅に変更せな >>2
失敗してるように見えるね。
数十レベルなら現状で製薬会社の持ってるアイデアリスト並みのことでしかない。 ＞治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している
まあ、両方間違ってる可能性もあるけどね。 >>7
そうかな？ この短期間で世界に名だたる欧米の製薬会社と同レベルなら、相当なものだよ。 すでに、効果と安全性が確立され、世界中で使用され
始めているアビガンが日本では医師の自由な裁量で
使用できない。極めて恣意的で異常な状態だ。 >>1
＞また、日本の製薬会社が特許を持っている物質も
＞シミュレーションではよい結果が出たという。
アビガン？ >>1
少し前の記事で、有料会員じゃないと後半読めないけど
富岳で新型コロナ治療薬の候補探索が加速、勢いづく日本の「AI創薬」：日経クロステック
https://xtech.nikkei.com/atcl/nxt/column/18/01327/062500008/
＞今回のようなシミュレーションは、「（富岳の前世代機である）京（けい）では到底できない計算量が必要」（奥野教授）という。富岳の計算能力は京の約50〜100倍とされる。まだ調整が完全でない段階の富岳でも思った以上の結果が出たことで、治療薬発見の期待はさらに高まる 入力した計算式とデータが正しければ、正しい答えが導き出される
現段階は、検証が必要 もう家のPCでFAHぶん回さんでもいいかいね
ぼちぼち部屋も暑いし >>15
アビガンは特許切れてる
だから中国で作ってる >>1
イベルメクチンのことだろ。 ならさっさと投与しろよ 【アアア嗚呼ッ！！それ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編】
Ａ型
ＺＯＯＭでチンコ出してシコる病
Ｏ型
ＴＶ電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
Ｂ型
気管支炎
AＢ型
脳梗塞
【うあああああ嗚呼ッ！それ血液型ですやん？・罹りやすい病気男性編】
Ａ型
ＺＯＯＭでチンコだしてシコる病
Ｏ型
ＴＶ電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
Ｂ型
気管支炎
AＢ型
脳梗塞 😣
【アアア嗚呼ッ！！それ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編】
Ａ型
ＺＯＯＭでチンコ出してシコる病
Ｏ型
ＴＶ電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
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気管支炎
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脳梗塞
【うあああああ嗚呼ッ！それ血液型ですやん？・罹りやすい病気男性編】
Ａ型
ＺＯＯＭでチンコだしてシコる病
Ｏ型
ＴＶ電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
Ｂ型
気管支炎
AＢ型
脳梗塞 >>6
やることは決まってて、問題はうん千とかうん万対象があるからそれらの「全てで評価を行う」ことですよ。
ここは力技の世界でスーパーコンピュータが生きる。 チンパンジーはＡ型とＯ型しかいないんだよな
つまりＡとＯはチンパンジーが少しだけ進化した生き物という訳だわ 科学板だけどお楽しみ韓国人の反応
カイカイ反応通信 - 世界1位の日本のスパコン富岳、コロナ治療薬候補を数十種発見＝韓国の反応
http://blog.livedoor.jp/kaikaihanno/archives/56936681.html >>18
この計算て動力学計算ですよね??
それ自体は大昔からある方法でスーパーコンピュータで実用的にできるようになっただけだと思うんだけど、それがいつのまにやAIの手柄になるんですかね?? （´・ω・｀） >>24
日本における物質特許は、富士フイルムが5年間の延長手続きを行っており、2024年まで有効。
なお、製造特許は中国国内でも有効。 >>16
富岳はスパコンじゃなくて正確にはサーバーなので、クラウドにも対応してまっせ >>7
本質を理解してないな
有効性が低そうというところまで総当たりで出来てるのがいいことなんだぞ エッ？ソウダナ・・・肩の筋肉の詳細な研究情報はあってもイイかもしれないな・・・。
編。完。 標的たんぱく質と強く結びつく薬を
抗ウイルス薬以外の既存薬も含めて調べた結果
何故か駆虫薬なんかが有効だったりする訳ね >>34
記事書いてる記者が馬鹿だから
>>22 の記事ではおかしなこと言ってない データベース構築しときなよ
ついでに生産し続けてくれる体制もな ∇ヒャッハーー！マジそれ血液型ですやん・罹りやすい病気男性編
⬛Ａ型男
ＺＯＯＭでチンコ出してシコる病
⬛Ｏ型男
ＴＶ電話でチンコ出してシコる病、妻DV離婚イヤ病
⬛Ｂ型男
気管支炎
⬛AＢ型男
脳梗塞
えっ！？マジそれ血液型ですやん？・罹りやすい病気男性編
⬛Ａ型男
ＺＯＯＭでチンコだしてシコる病
⬛Ｏ型男
ＴＶ電話でチンコだしてシコる病、妻DV離婚イヤ病
⬛Ｂ型男
気管支炎
⬛AＢ型男
脳梗塞 すでに答えは出ています。
日本株BCG接種が、有効です。
ハンコ注射が有効です。
米国で、富裕層は数千ドル払って、BCG接種しています。
BCGだと儲からない製薬会社が、洗脳工作
研究費確保のYMNK教授の言動は見苦しいです。 既存薬剤の活用の利点は副作用の検討が最小限に済むことだ
何の病気、症状に使おうが副作用は同じだからね
既存薬剤を対コロナに活用できるなら、効果があるなら、とりあえず現段階ではとても有用だよ
今はとにかくスピードが大事 >>1
数十年前の巨大コンピューターのスペックがポケットに入る時代になったけど
数十年後に富岳並みのスペックがポケットに入ったりして 京で2000種1年かかってたものが、富岳では10日だって。
チューニングが終われば2日だと。
凄まじいね。 何となく正露丸が効きそうな気がするんだが・・・ダメか？ SARS-CoV-2のメインプロテアーゼ (Mpro; 3CL加水分解酵素)と
SARS-CoV-2 3CLpro というのが同じものなのかな。
だとすると、清肺排毒湯、柴葛解肌湯、小柴胡湯加桔梗石膏、などの柴胡剤といわれる
中医薬・または和漢薬が効果がある。
要は、これらに含まれる生薬の、黄芩に含まれるフラボノイドのバイカリンと
バイカレインが、結合ポケットにぴたっとはまって、盾となって防ぐことで坑ウイルス剤
となっているようだ。
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.13.038687v1.full
https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/04/14/2020.04.13.038687/F2.medium.gif
柴葛解肌湯は、葛根湯と小柴胡湯を併せて飲んでもほぼ同じで、スペイン風邪のときにも
この処方で治療すれば、極めて高くい効果があったという。 2月5日のニュース
https://pdbj.org/news/20200205
[wwPDB] 新型コロナウイルスプロテアーゼの構造が公開されまし ...pdbj.org › news
2020/02/04 - 新型コロナウイルス（2019-nCoVコロナウイルス）由来の3CL加水分解酵素(Mpro)の高分解能の結晶構造を、上海科技大学のRao Zihe氏とYang Haitao氏が率いる研究チームが決定しました。
5月1日に更新された記事では
新型コロナウイルスのメインプロテアーゼの構造を解析し、治験薬からその阻害剤を発見
http://crisp-bio.blog.jp/archives/22104442.html
薬剤7種類 (FDA承認薬のdisulfiramとcarmofur; 治験薬の ebselen, TDZD-8, shikonin,
tideglusib, ならびにPX-12)を同定した。
7種類の中では、セレンを帯び抗炎症・抗酸化・細胞保護活性が知られており細胞毒性も
極めて低いebselenが、最も強力な阻害剤 (IC50 0.67μM)であった。 そもそも2012年の
https://astellas-swift.secure.force.com/byoutai/servlet/servlet.FileDownload?file=00P1000000vK0yeEAC
プロテアーゼ阻害剤による呼吸器系ウイルスの制御
国立感染症研究所 ウイルス第三部四室 松山州徳
急性呼吸器感染症に関わる多くのウイルス（インフルエンザ、コロナ、パラインフルエンザ、
メタニューモ等）は、肺に存在するプロテアーゼを利用して増殖することが知られており
、プロテアーゼによって組織特異性（トロピズム）と病原性が決められている可能性があ
る。呼吸器系ウイルスの感染に関わるプロテアーゼは数種類報告されており、プロテアーゼ
阻害剤を組み合わせれば、様々なウイルスの感染を特異的、効率的に抑えることができ
るはずである。宿主プロテアーゼを抗ウイルス薬の標的とすることで多種のウイルスへ
の感染阻止効果が期待でき、膨大な種類が存在するといわれる呼吸器系ウイルスの何割
かを、まとめてカバーする薬を開発できる可能性がある。 で、2016年に
https://www.amed.go.jp/news/release_20161122.html
「重症急性呼吸器症候群（SARS）コロナウイルス[1]」の主要なペプチド結合加水分解
酵素「3CLプロテアーゼ[2]」が基質（酵素が作用する物質）を認識する際に示す新たな
アミノ酸配列特異性を発見しました。
中略
今回発見した特殊な認識様式と認識配列は、自己プロセシングの効率を低下させず、生
成される成熟型3CLプロテアーゼのC末端領域の自己阻害活性を抑制する“SARSウイル
スの巧みな戦略”であると考えられます。これを逆手にとれば、この自己プロセシング
のみに用いられるメカニズムをターゲットとする極めて特異性の高い創薬の開発が期待
できます。 これって、DNAの組み合わせをつきあわせて
タンパク質がくっつきそうなのか予想をするってこと？ とにかく、早く被験者に飲ませてテストしろや。
黒人患者が多いから、そこに投与しまくれや。
副作用でおかしくなっても、白人警官による
虐待死に比べれば全く問題ねえわ。 どんどん
人体実験に使えばヨロシ♪ >>48
数十年後と言わず、あと二十年もしたら量子コンピューターがパソコンになるんちゃう。 >>40
普通の見解だぞ
すでにクラウド的な運用やろうって話になってるし
ttps://www.r-ccs.riken.jp/library/topics/200213.html
そもそもやろうと思えばOSをAndroidにだって出来る汎用性が富岳の売り
今までの尖ったスパコンとはまったく違うし、だからこそ本格運用前からコロナの新薬研究とかに投入できてる >>62
>だからこそ本格運用前からコロナの新薬研究とかに投入
関係ないだろｗ なんでもホルホルやってバカ丸出しｗ >>22
これね
スパコン「富岳」、わずか10日で2,000種類超の新型コロナ治療薬候補を選別：PC Watch
2020年7月6日 06:10
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1263445.html 世界の他のスパコンの数分の一の時間で絞り込めたのは良いね！ >>65
絞りこめたという保証はどこにあるの？ 最良のものが漏れていることはないわけ？ ていうか山中教授のことだったら
「ああ、やっぱりネトウヨかｗ」ということにしかならないんだけどｗ
（またいつものＢＣＧ脳だし、そうなんだろうｗ） 安倍
今年中にワクチン完成！
来春世界の皆さん接種！
7月完全な形で五輪開催！
↑
また口だけ。 >>62
クラウドに対応しているということに驚いたのではなく、スパコンでなくサーバなので、クラウドに対応できたというところに、反応しただけです。どーでもいいことですけど。 >>9
短期間？
そもそも0から作ったわけでもないのに。
>>29
バカにはそれすらわらんか？
>>38
本質は数千億かけて、目に見える成果はゼロだということだ。
わかるか？間抜け。 >>62
仮想OSなんてできて当たり前だ間抜け。
何を当たり前のことに感動してるんだか。 まあこの手の新薬の候補を100造ってみても、そのうち1つすら実用に市場に出せる
段階にはたどりつかないんだよ。仮にターゲットの細菌とかウィルスには極めて
有効でも、正常な機関や組織に害をもたらしたり、後遺症が生じたり、ショック
を起こしたり、依存性が出てやめられなくなって早死にしたり、たちまちターゲット
が耐性を獲得したりするようだと、没にせざるを得なくなる。
だから、万に一つもあたらない。土中の細菌の出す物質を片っ端から
スクリーニング試験してみる方が良いぐらいじゃないのか？ 要するにスパコンで絞り込んでも「結局、人体実験しなきゃわからないｗ」ってことじゃん？
治験にどれくらいの日数かかるか判ってないんじゃない？
この危機下に悠長なことよｗ
今のスパコン絞込みってのは、ヘタな鉄砲状態だな
「提案するだけで、実行は貴方ですよ、このレポートに責任は取りませんｗ
使えなくても損害賠償請求できませんからｗ」状況
提案するのはわずかの時間かもしれんが、人間が膨大な時間かけて実行して、
提案の中のまぐれあたりに期待するほかない
数千億もかけても効果が薄い
もう数千億かけて治験までスパコンでやって
人の手を介在しないで完結してくれるレベルまでいけばいいのかもだがね ■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
