そもそもセクタ０「IPLなど」は、ファイルシステムの管理にすら入っておらず、ファイル・ディレクトリ単位の操作では触ることすらできません。
一般プログラムには基本的にセクタ単位で操作するAPIは必要ありませんし、デフォルトでは与えません。なぜセクタ０が書き換えることができるのでしょうか。
「セクタ０問題」もきちんと作れば不可能なのです。ブログに書いてあります。