まとめて取引を断るときの質問です

落札後に送料を連絡する設定で出品
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CD2枚落札
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まとめて取引依頼
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断って単品取引（同梱OK、2点目は送料0にするから決済は1点ずつしてくれとメッセージで伝える）
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で、クリポやレタパなら問題はないのだが
ヤフネコ宅急便（60サイズ・東京→東京486円）を指定されたとする
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ヤフネコだと送料が勝手に入力されて2点目を送料0円にできない

こういうときってどうすればいいの？(´・ω・｀)