レガシーブートしたPEメディアからEFI形式のストレージへとリストアしても、UEFIファーム側へのブートマネージャへは登録されない可能性があります
BCDファイル内ではないですよ　当然だけどね
それと、PEメディアはMBR形式で作成されているけど、FAT32領域からのブート仕様を守っているので、
古いUEFIファームからでもブートします
マイクロソフトのインストールメディアと同じ理屈ですね