>>738
シェルスクリプト組む気があれば、 windows 標準の robocopy でいくらでもどうにかなりそうだが。
/XC /XN /PURGE オプションをつければ変更のあったファイル、新規ファイルを除外して今は無いファイルを削除してくれるから、
それで robocopy を実行した上で改めてもう一度 robocopy　を それらのオプションを外して実行すれば、ご希望の要求は満たせそう。