1. 奇数と偶数を分ける
エクスプローラーでアイコンなど大きい表示にして幅を縮めて、
縦二列表示にしたら片列だけ縦に選択して別のフォルダに移動させる。
2. それぞれ一つとばしの番号を振りなおす
例えばFlexible Renamerの高度なリネームに「ステップ」という設定があり、
これを2にすると一つとばしの番号を振れる
3. 分けたものを合わせる

最初がちょっとアホくさいけどｗ
たぶんリネーマーだけでも出来るんだろうけどミスしないように単純な操作で。