Googleアプリは別に無効化しても他のアプリに影響出たりしないよ
俺も無効化してる
普通に無効化してるだけだけど勝手に更新されるようなことはないよ

唯一困ったのがリマインダー
Googleアプリのリマインダーを使ってた
今は別アプリに乗り換えて解決