>セーフモードを使うのってなんか悪影響とかある？
セーフモード自体というか起動させることに悪影響があるという話は聞いたことがない

ただし
>何かをきっかけにeマークになることがあるので
それが何度も起こっているとしたら、何かどこかに問題か過負荷がかかっないか？