返信どうもです。Lootは使っています。
合計プラグイン数は132、アクティブなプラグイン数は109、となっています。
以前のNMM環境の時もBashed Patchを作成するとマージされたespはLoot上で外れてゲームでは問題なく反映されていた記憶なのですが、Loot上でespが外れてたらまずかったでしょうか?