>>402
原因は色々あるんだけど

1. Mod Manager 1.1用の Manifest.xmlの記述方式になってないModが多数ある
  依存ModのIDが workshop IDになっていたり、About.xmlで宣言されてる
  packageIdになっていなかったり

2. Mod Managerそのものの読み取りエラーが若干ある
  ModのVersion番号の指定が二重表記になってるModがあったりして
  その場合Mod Managerで赤色三角エラーを吐く (動作は問題ない)

3. 1.1より前の古いセーブデータから読み込むとIDを正しく読み取れない

この辺かね