やっぱり直ってなかった
というわけでメモ

ToVでAボタンが効かない場合の対処法

※ゲーム内部のバグなのでOS、ユーティリティ、Steam側のコントローラ設定は関係ない

・ゲーム起動時に毎回キーボード操作に戻ってしまう場合は、キーボード操作でセーブデータのロードまでを行う
・ゲームが始まったらTABで設定画面を開いて1Pの操作をコントローラに切り替える

・フィールド画面で人に話しかけたりしてAボタンが効いているかを確認する
・効いていなかったらCtrl+Alt+Del、Alt+Tでタスクマネージャを起動
・デスクトップに切り替わったらAlt+Tabでまたゲームに戻る
・再度Aボタンを押して利いていなかったらCtrl+Alt+Delからの手順を繰り返す
・Aボタンが有効になっていたらプレーできる