その手の変更はゲームの途中から導入しても、すでに生成されたキャラが置き換わったりはしないよ
なのでインポートしたくないなら、これから新しく生成されるSquadに出現するように設定しないといけない
ランダムスポーンの遊牧民なら大丈夫だけど、それもすでに出現済みの部隊が残ってたら何らかの手段で消えてもらわないと