鯖起動するbatファイルに記述すればそれらの設定は使えるよ　本家がそうだったからね
こっちだと一部設定は変更できるけど経験値とか採取量とかは変更できないよ　バグだと思う
現在変更できる項目は
･飛行生物で陸上生物をつかめるようにする
･ダメージ表示
･難易度設定
･テイムできる恐竜の上限
･ヒットマーカーの表示
くらいだね true falseで設定できるものはだいたい設定できると思うよ

iniファイルを直接変える場合はGameUserSettings.iniを変えればいいよ