ゾディみたいな強力な蛮神を維持させるには魂入れとかないといけないんでしょ？
バハムートをダラガブに突っ込んだ時に仲間のドラゴンも大量に入れたのと同じで
ハバに詰め込んだのは分エメトセルクだから理屈は同じなんじゃないの
魂を引き上げられるんだからゾディ復活して冥界に戻った古代人の魂はエメ自身が何とかしようとしたのかも