ver4とve5を逆にしてくれた方がストーリー的にも組みやすかったんじゃないかなあ。
主人公の兄弟姉妹にしてもver5.5で突然アストルティアの主要施設の設立に携わった回想があったけど、あれこそver4でやったほうが未来と過去の対比ができてた気がする。
「闇の根源との契約が兄弟姉妹にかかった時渡りの呪いを上書きした」よりも「時見の箱が時渡りの呪いを吸収した」とかストーリー改変すれば、より整合性のある形で物語が展開できてたし。