空気の吸入量が増えたなら
１）フィルターを少し遮蔽などして空気吸入量をもとに戻す
２）キャブのメインジェットの番手を上げて混合比を戻す
３）サイレンサーバッフルはとりあえず無関係

なにを目的にフィルタを変えたの？