エルドラージ=多元宇宙の管理用、みたいな考えだと、
殺さずとも封印することで結局多元宇宙に問題が生じると思うんだけどな

問題の解決策がエルドラージの解放以外にあるというなら殺してもいいし、
他に解決策がないなら野放しで管理(次元消滅)させることこそ長期的に見て問題なさそう