0467卵の名無しさん
2020/05/18(月) 20:47:32.80ID:t88GB6THhttps://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5
のRのコード
https://github.com/ehylau/COVID-19/blob/master/Fig1c_Rscript.R
と
西浦モデルのコード
https://nbviewer.jupyter.org/github/contactmodel/COVID19-Japan-Reff/blob/master/scripts/C.%20Calculating%20the%20Rt%20in%20Stan.ipynb
から発症間時間(serial interval)の分布を重ねてみた。
https://i.imgur.com/vrnra5F.png
> c(Mode,mean,var) # Xi He
[1] 3.630563 5.982241 20.728221
> c(Mode,mean,var) # Nishiura
[1] 4.259623 4.830129 4.940682