泥が溜った時にいちいち蓋外して掃除だとか
その他、水の管理の問題でむき出しのほうが作業し易いから

増水時（大雨・台風）には水門的なもの
（木の板で流れせき止める・余所に誘導）で流れ変えたり
色々やることあるんだそうな

これが伝統の「田圃を見に行く」「用水路を見に行く」が発生する理由