【医学】コロナ薬候補を数十種類　スパコン「富岳」で京大発見 [しじみ★]

**しじみ ★** · 2020/07/06(月) 05:43:37.10

京都大学の奥野恭史教授らは3日、世界最高の計算速度を誇る理化学研究所のスーパーコンピューター「富岳（ふがく）」を用い、新型コロナウイルス感染症の治療薬の候補となる物質を数十種類発見したと発表した。細胞内でウイルスの増殖を妨げる可能性がある。今後は細胞を使った実験などで効果を確かめる方針だ

理研副プログラムディレクターを務める奥野教授らは、富岳の高い計算力を使い、既存の薬剤2000種類以上を対象にシミュレーション（模擬実験）を実施した。ウイルスの増殖に関係するたんぱく質にくっつき、その働きを妨げる効果がどの程度あるかを調べた。

この結果、治療薬として有望だと考えられる数十種類を絞り込むことができた。この中には、新型コロナ向けに世界で臨床試験（治験）が進む薬剤が12種含まれていた。いずれも寄生虫の薬である「ニクロサミド」や「ニタゾキサニド」などで、ニタゾキサニドは既に米国やメキシコで治験が進行中だ。

また、日本の製薬会社が特許を持っている物質も、シミュレーションではよい結果が出たという。奥野教授は「富岳の計算でリストアップした中に、治験が進行中の薬剤が含まれていたことは、計算が正しいことを示唆している」と話す。

今後は細胞を使った実験で、薬剤の効果を詳しく調べる。製薬会社や研究者と協力し、臨床研究や治験についても検討する考えだ。

富岳はスパコンの計算速度を競う世界ランキング「トップ500」で6月に首位となった。2011年に首位だった「京（けい）」が1年かかる計算を数日でできる計算能力をもつ。当初、21年から運用する予定だったが、新型コロナ研究のために今年4月に前倒しで使い始めた。

https://blogimg.goo.ne.jp/user_image/35/52/0948613f72d7c41464d1cdd16a3e5422.png

日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXMZO61137980T00C20A7EA5000/

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 05:14:09.72

>>77
＞だから、万に一つもあたらない。土中の細菌の出す物質を片っ端からスクリーニング試験してみる方が良いぐらいじゃないのか？

数十日で候補があがり、その後治験というのはわかるよ。
じゃあ「片っ端からスクリーニング試験」にはどれくらいかかるのかな。

>>78
＞要するにスパコンで絞り込んでも「結局、人体実験しなきゃわからないｗ」ってことじゃん？

その通り。
じゃあ、従来の方法で絞り込むのに、コストと時間はスパコンいらないレベルなのかな？

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 12:30:40.52

初めて効くかも、って言われたシクレソニドが3/3に報告上がってたから1月とかに富嶽があったならある程度有効に使えたんじゃね？
次回以降に期待だな

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 13:13:22.80

極めて有効なのなら、各製薬会社が自前で大規模サーバーマシンをたくさん
秘密裏に購入して、警戒厳重な場所に置いて、延々と電気を食わせて
候補となる物質を探させれば良いだけのこと。税金を使って製薬会社に
ただで情報を提供する必要は無いだろうに。Ｆ社もマシンが沢山製薬会社に
売れたらうれしかろう。

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 14:04:26.63

>>81
国策だから。
民間企業に何か恨みでも？ｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 16:04:22.37

税金にただ乗りしている。

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 16:51:21.62

候補化合物からの開発費用だってただじゃないんだぞ
すでにある化合物が有望ってデータが出て開発の後押しになるなら
それは国益になるからそもそも医薬品ってそういうところあるき
オーファンドラッグの開発に金出したり候補企業募ったりとか

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 19:21:34.24

>>83
税金の使い方としては、おれは真っ当だと思うよ。
だいたいそんなに使ってないだろｗ
理研と富岳動かしたって数億円で済むと思う（適当だけどｗ）。
ご不満なら、お前さんは何に使う？
たぶん国民に配れと言うのかなｗ
こないだの10万円、いくらかかったと思う？ｗ

それと、民間が富岳レベルを導入するのにいくらかかって、どれだけの時間がかかるか考えた？
いいよ、5年かかって企業財政ボロボロにするなら。

もう少し現実的に考えなよ。

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 23:20:07.68

富嶽で日本社会の格差問題の解決もできるだろ？
さっさとBI導入しろよ

**名無しのひみつ** · 2020/07/07(火) 23:49:59.36

>>77
まず最初に言っておくと新薬じゃない
日本語読めない人は話に入るなよ

**名無しのひみつ** · 2020/07/08(水) 07:58:39.32

偏見ありすぎる結果だな
鋭いナイフは使うやつ次第

**名無しのひみつ** · 2020/07/08(水) 18:35:03.96

たとえば、あらかじめ実際の物質実験によって
ターゲットと親和性の高い物質をいくつか見つけておく。

そうして、そのような実験結果が既に存在することを伏せて置いて、
それらを含めておいて多数の物質を計算機シミュレーションで計算して、
それらを「発見」する。

そうして実験結果を付けて、実験で確かめたら確かにその通りだった！
といった具合にものごとの順序を逆にすると、コンピュータによる計算は
とても予言力があるんだということを宣伝できる。

そういうことをしていないかどうかは第三者にはわからないからな。
そういうことでなければ良いがね。

**名無しのひみつ** · 2020/07/08(水) 19:33:28.18

>>89
世の中の陰謀見破ってすごいすごい

**名無しのひみつ** · 2020/07/08(水) 23:00:21.47

こういうやつを治す薬の優先順位は著しく低いだろうからどうしようもないね

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 06:35:18.68

>>50
京で開発したアプリを富岳に移すだけだ性能が出ないというトホホな実情だね。
しかもチューニングあり、なしでは5倍も違うと。
使いやすいスパコンっていうサギ宣伝にだまされてるなｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 06:49:53.55

>>89
実験結果が予想と合致しなかったらどうすんだよ
実験結果を捏造すんのか？

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 06:50:48.73

　

どういうプログラムなのかな？

誰も指摘しえなかった、思いもよらないものが出て初めて評価される。

多くの業界人があれなら効くかもって思ってるモンばっかりじゃ、
無駄に電気遣っただけってこと。

　

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 06:54:58.33

>>93
実験結果にあうようにパラメータをちょこちょこっと変えて、
従来予測が困難だったものが予測可能となった！！！　とどや顔で宣伝するだけｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 06:58:39.69

　

スパコン「富岳」で「京」大発見

だったりして。

　

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 07:12:58.88

>>89
そもそも量が多すぎて物質実験で見つけるのが難しいっていう話なんじゃないかな

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 07:29:28.17

>>97
だからといってやみくもに数値実験したわけでもないだろ？
それなりの方向と思われるものを2000種ぐらいピックアップして、その中から数十種類を選んだってわけでしょ。

問題は、
(1) その数十種も、まあそうなるよね、ってものなかのか
(2) その数十種の中に、本当の最適種が含まれているのか（漏れはないのか）
ってことなんだろうけど、ただただ、富岳すごいでホルホルしたいだけの記事でそういった情報がまったくないｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 07:36:27.86

丸山ワクチンでOK?

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 09:06:14.88

>>93
>>>89
>実験結果が予想と合致しなかったらどうすんだよ
>実験結果を捏造すんのか？

そういうときは、計算の候補から取り除いて、握り潰して
計算で予測を最初からしていないことにすればいいのさ。
そうすれば、実験との比較も載らない。
もちろんこれも、（不公正な）トリックになる。

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 10:00:46.79

>>100
捏造すればすごい論文が書けるとドヤ顔で
言える根性に感心するよ

**名無しのひみつ** · 2020/07/09(木) 21:05:14.34

ニクロサミドも富士フイルム系か
承認されないな

**名無しのひみつ** · 2020/07/10(金) 06:07:45.16

>>51
フリスク舐めてると予防に効きそうな気はするw

**名無しのひみつ** · 2020/07/10(金) 06:16:56.93

>>98
闇雲にってなんだよスパコン舐めすぎ
人間が絞らずに総当たりでやってるわ
ビッグデータとか騒がれてる時代に人間が絞ってやるなんてアホなことやるわけないだろ

**名無しのひみつ** · 2020/07/10(金) 12:29:50.59

計算結果が実験結果と良く合うときにだけ論文を書き、
計算結果が実験結果と良く合っている論文だけが受理される。
　後日、実験結果が訂正されて大きく狂ったら大恥だけれども、
それはそれで、またその結果に合うような理論補正を入れて
結果があった時だけ、論文にして投稿する。そういうものらしい。

**名無しのひみつ** · 2020/07/10(金) 13:10:40.98

>>105
自分がインチキクズ野郎だからと
他人もクズだと決めつけないように

**名無しのひみつ** · 2020/07/10(金) 22:08:32.55

>>104
たった2000種が総当たりｗｗｗ
おまえのバカっぷりがよくわかるわ

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 01:48:24.45

>>107
どうしたらこんなバカさらして恥ずかしくないのか謎の

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 05:00:50.74

>>108
https://www.r-ccs.riken.jp/jp/fugaku/pi/drugdiscovery
>631種類のタンパク質と3000万種類の化合物の間でバーチャル・スクリーニング
おまえの世界では2000種が総当たりなんだよなｗｗｗｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 06:05:25.32

>>109
化合物と医薬品が同じものという理解ならそうなるのもしょうがないね
今回はスピードが求められるわけでドラッグリポジショニングを
やろうって話なのにまだ医薬品としての承認も受けてない化合物含まれた
3000万種の話を持ってくるのはいったいどうしたことだろうと思った
医薬品と名前のついたものだけをセレクションしたんだろw
っていう反論をするならもう何も言えることはないが

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 06:13:34.00

>>110
>医薬品と名前のついたものだけをセレクション
だから、それのどこが総当たりだっていってるわけだｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 06:19:53.58

たかだか2000種がビックデータｗｗｗ
アホの世界ではそうなんだろうなｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 06:41:56.91

富岳「・・・・・・・オロナイン軟膏です」

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 08:10:28.58

大麻でコロナが治ることが動物実験で確認された
https://www.excite.co.jp/news/article/Buzzap_64680/

では大麻とはどのようなものか見ていってみよう（買える大麻でその様相を分析）
http://v.cafeblog.jp/archives/6406884.html

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 09:17:47.29

>>112
日本語読めないなら黙ってりゃいいのに

**名無しのひみつ** · 2020/07/11(土) 10:09:04.88

>>112
ビックデータワロタ

**名無しのひみつ** · 2020/07/12(日) 00:42:31.94

やたら批判的な人ってどんな人なんだろうな
自国でスパコン作れない国の人かな

■韓国　3台

18位　ヌリオン（米国クレイ社制）　　1秒間に1京3929兆回の計算
139位　ヌリ（米国クレイ社製）　　1秒間に2395兆回の計算
140位　ミリ（米国クレイ社製）　　1秒間に2395兆回の計算

**名無しのひみつ** · 2020/07/12(日) 01:13:44.71

たかが2000種でスパコンなめるなだってさｗｗｗｗ
アホの中ではすごいんだろうなｗｗｗ

**名無しのひみつ** · 2020/07/12(日) 01:14:24.38

ビックデータわろた

**名無しのひみつ** · 2020/07/12(日) 01:22:50.50

>>118
どこらへんが凄くないの？

**名無しのひみつ** · 2020/07/13(月) 12:58:14.25

今後どんなウイルスにも応用ができるんだから
製薬会社よりスパコンのほうが上だわ

**名無しのひみつ** · 2020/07/14(火) 21:46:50.53

>>74
国産スパコンのスレとなると、こういう発狂するのが常駐するんだよな

**名無しのひみつ** · 2020/07/14(火) 21:48:43.24

>>44
分子構造自体はデータベース化されてる

対象が変われば振る舞いも変わるのだから、あとはそれに応じて今回のように高速なシミュレーションを走らせるんだよ

**名無しのひみつ** · 2020/07/14(火) 21:49:34.70

>>92
>>122

**名無しのひみつ** · 2020/07/14(火) 22:07:12.41

>>47
アビガンじゃダメですか？

**名無しのひみつ** · 2020/07/15(水) 04:38:45.62

富士通研究所、“次元の呪い”回避する世界初のディープラーニング活用技術を開発
https://pc.watch.impress.co.jp/docs/news/1265205.html

**名無しのひみつ** · 2020/07/15(水) 07:46:26.58

え!また犬の虫下しが効くの？

**名無しのひみつ** · 2020/07/16(木) 03:33:52.14

アンモニアを安価なニッケル触媒で合成…東工大グループが成功、貴金属使わず生産へ
https://www.yomiuri.co.jp/science/20200716-OYT1T50128/

**名無しのひみつ** · 2020/07/29(水) 12:55:13.05

生まれつきある種の細菌とかウィルスに耐性を持っているのだとしたら、
それはDNAに書き込まれた情報を使って、細胞内にある種のペプチドや
RNAが作られていて、細胞内に侵入したウィルスの酵素やRNA/DNAなどと
相補的に結合して増殖を抑制・制御できるようになっているからかもしれない。
あるいは、生まれつきそのような細菌やウィルスに対する抗体の設計図が
動物のDNAに存在して、それに基づいて切り貼りをして抗体が作られる
からかもしれない。ジャンク領域と言われている箇所が怪しい。

うまく、細菌あるいはウィルスを制御して、飼い慣らすことにより、
細胞内器官のようにその機能だけを上手く使って必要な栄養素を得たり
（たとえば腸内細菌など）、あるいは飼い慣らして宿主は耐性を得ているが、
その宿主の天敵に対しては強い病原性をもたらすのだとすれば、種として
外敵に対する防衛機能をもたらすことになる。

【医学】コロナ薬候補を数十種類 スパコン「富岳」で京大発見 [しじみ★]

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