メニュー→アカウント設定→サーバー設定の「メッセージの保管場所」はどうなってるんだ？
使用プロファイルが11111.defaultなら、
C:\Users\(OSユーザー名)\Application Data\Thunderbird\Profiles\11111.default\Mail\(メールサーバー名)
が既定

「相応しくない」と出るのは他のプロファイルフォルダ（たとえば22222.default）の中が指定されているような場合