MSBuild /p:Configuration=Release;WholeProgramOptimization=PGInstrument citra.sln
で60くらい
MSBuild /p:Configuration=Release;WholeProgramOptimization=PGOptimize citra.sln
で20くらい警告ですな
エラー出たら失敗します

pgort140.dllがあるのを確認する(win10の場合) ↓デフォならここ
C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio\2017\Community\VC\Tools\MSVC\14.11.25503\bin\HostX64\x64\pgort140.dll