/FixBoot
このオプションを指定すると、Windows Vista または Windows 7 と互換性があるブート セクターを使用して、
新しいブート セクターがシステム パーティションに書き込まれます。
次のいずれかの条件に該当する場合にこのオプションを使用します。•ブート セクターが、
標準でない Windows Vista または Windows 7 ブート セクターにより置き換えられた。
•ブート セクターが破損している。
•Windows Vista または Windows 7 がインストールされた後に、
それよりも古いバージョンの Windows オペレーティング システムがインストールされた。
この場合、Windows ブート マネージャー (Bootmgr.exe) ではなく Windows NT Loader (NTLDR) を使用してコンピューターが起動します。

すなわち、バーティション先頭のセクタ(PBR)にあるIPLを書き換えるコマンドです
GPTディスクの場合にはロード方法が違うので全くの無意味
MBRのブートコード　----->　アクティブパーティションになっているIPLへと繋がります