全部のサブフォルダの中のファイルをリスト表示する仮想フォルダとか欲しい。

一応現在の機能でも空フォルダ相手に下のディレクトリコンペアをやると実現できるけど。
DirectoryCompare(FDCMP_None, FDCMP_None, true, false, true)