フォントの問題じゃないでしょ
BathyScapheで表示するレスの&なんちゃら;は
BathyScaphe.app/Contents/Frameworks/SGFoundation.framework/Resources/xml_entities.plist
の中身に従って置換がかけられているけど
何らかの理由でその置換がうまく動いてないという理由ぐらいしか考えられない
例えばそのplist自体がパースエラーとかgatekeeperでブロックされて読めないとかね