うちの場合、

外付けSSDにでかいファイルを保存していた。
→そのSSDを臨時でPS4で使用したくなった。
→この状態のバックアップあり
→SSDのデータをHDDに移動する。
→外付けSSDを取り外して、PS4でフォーマット
→いろいろした後、外付けSSDをMacに戻して、フォーマット
→HDDのデータをSSDに移動
→この状態でバックアップ

すると、
フォーマット前のSSDと、フォーマット後のSSDが、
別のSSDと認識されるので、バックアップデータが二重に出来る。

そしてフォーマット前のSSDのバックアップデータを消したいんだが、方法あるだろうか?