PCのスペックが分からんけど、一時的に発生してまたもとに戻るんなら、
バックグラウンドで何か重い処理が発生してるんじゃね？
ウィルス定義ファイルの更新とか。
症状が起こってる時はHDDのアクセスランプがチカチカしてるかもね。