>>52
for文についてググってみたw
今コンソールが使える状況じゃないので未確認だけど
こんな感じのファイル名にして
v1.mkv a1.mp3
v2.mkv a2.mp3
v3.mkv a3.mp3
この前提で以下のfor文でどうかな？
for /L %%n in (1,1,3) do ( ffmpeg -i v%%n.mkv -i a%%n.mp3 )