Windows       : ~ (全角チルダ)
その他あらゆる物 : 〜 (波ダッシュ)

これ、実は Windows の方が間違っているんだよ。
だけどその間違っている方が圧倒的シェアを占めていたから、
例えば「確信犯」の誤用みたいな感じで間違った方が普及してしまったという訳。