Android版RetroArch 1.9.11 64bit+np2kai 0.86 56535cdでは問題ないことを確認しました。
Windows版Retroarch 1.9.11 64bit+np2kai 0.86 56535cdではHDDイメージを起動後に「UMB領域〜」が表示されたとこでRetroArchが何も表示せず落ちます。
Windows版Retroarchのバージョン1.9.12を新規インストールしてみましたが改善しませんでした。

現在RetroArch内からダウンロードできるコア(0.86 56535cd)と下記アーカイブ内のコアはハッシュが一致しました。
https://buildbot.libretro.com/stable/1.9.12/windows/x86_64/RetroArch_cores.7z
SHA-1: 7fbce93adf22d0cf0c3ef728b3c098788ce39ccc

下記アーカイブ内の古いDLLファイル(0.86 56535cd)を手動インストールして正常にHDDイメージを起動できる事を確認しました。
https://buildbot.libretro.com/stable/1.9.11/windows/x86_64/RetroArch_cores.7z
SHA-1: 534af3fffb6554b4865c7a489367ff931288e1f3