回数ぶん実行できない理由はわからないけどentry数に
原因があるならそこから問題の切り分けをしてみてはどうか

jscriptでdos窓出さない方法はshell.run()くらいしか思いつかない
シェルコマンドならPPx.Execute("%Obd cmd > nul")でいけるかも