今、再検証してみたが、>>66さんの言うことが正しかったかもしれん。
te210422.zipをダウンロードして、解凍し、TEを起動する。
「自動的に整列（最新の情報に更新）」にチェックして、それ以外は何もいじらず。
で、適当にファイルをコピーして貼り付ける。
だが、自動的に整列してくれなかった。

整列してくれた時と何が違っていたかと言えば、エクスプローラーを同時に起動していたかどうか。
整列してくれた時はエクスプローラーも起動し、整列してくれなかった時は起動していなかった。
つまり、TE単体だけでは自動的に整列はしてくれないということ。
これ、自分だけだったらおま環ということになるんだけど、ほかの人はどうでしょうか？