>>724です。
お騒がせしました。自己解決しました。
aviutl本体のシステムの設定からキャッシュサイズを増やすことで改善しました。
8GBの動画を読み込んで分割、カット、シークしても待ち時間0になりました。

>>725
拡張編集プラグインの質問ではなくaviutlの設定かと思いこちらに質問させて頂きました。

>>726
小さいサイズの場合でも同じディスクに置いているのでディスクの場所は関係無さそうでした。
一応どちらの場合でもSSDに置いて読み込んでいます。