>>216の画像をDLしたらアルファチャンネルがなかったので

色つきの毛玉部分を「色を透明度に(白)」で透過 → 中心部分だけ「後ろ」モードのブラシで白塗り
→ レイヤーの自動切抜き → 不透明部分を選択範囲に → コピー

で、ダマシダマシやってみただけなんだけど
クリップボードブラシのエッジが黒くなる現象は確認できなかった
@GIMP2.6 on WinXP

https://i.imgur.com/vP0iFWP.png

いちばん右はパスの「境界線を描画」:ブラシ
左と中央のはふつうのブラシストローク

ブラシツールの設定
「重ね塗り」オプション ON
「ブラシ感度」設定すべて OFF