どうもありがとうございます。
robocopyの不具合、OSやファイルシステムによっておきるようですね。
コピー漏れが生じるのは、サーバ（CentOS+Samba）やNAS（QTS）からコピーするときで、コピー先がNTFSかext4かにかかわらず生じます（コピー元がNTFSのときは大丈夫です）。
実行後のログに示されるファイルの合計数も足りませんので、コピー元にあるファイルが見落とされるようです。
代替ストリームのない、ふつうの文書や画像のファイルなのにです。
これまでオプションをあれこれ変えてみたのですが、解決できませんでした。