Portableを使ってるんで、Portableからの推測になるけど
たぶんIron_Backup_Config.exeっていうファイルが存在してないかな？
俺はいつもIron_Backup_Config_Portable.exeっていうもので環境を受け継いでるけど
またbookmarkだけならブックマークマネージャからエクスポートしたものを
同じくインポートすれば継承できるよ