エクスプローラーのサムネイルはこのソフトには関係ない話だよ。
「エクスプローラー 画像 サムネイル WebP」あたりでググれ。

回転は、回転させた後にWebPで保存し直す。当然劣化する。
現状JPEGみたいに無劣化で行う機能はない。