それはブート修復をしなかった（正常に出来なかった）からだろうな
もし、それが出来ないとしたらイメージバックアップ取っておいても元ドライブが壊れた時に新しいドライブに交換して復元ができないよね？
いちいちＯＳインストしてリカバリなんていう無駄なこともやる必要はない
ただ、何回か出ている話だけどこのソフトはメーカー製ＰＣのリカバリパーティーションが混じるとドットバイドットじゃないとパックアップ出来ない場合があったりするし、クローンで出来るならば一発で終わるからクローンでやっていいとおもうよ