自分は軽快さとかタッチ操作・ペン操作との相性の良さからUWP版を使ってる。
自分が欲しい機能に限ればUWP版でも満足してるからね

でもOffice 365のOneNoteの方が機能面で充実してるのは確かだろうし、要するにどっちを使おうが自分が気に入ってるならいいんじゃないすかね