ないと思う
ソートのコマンドにそのオプションがあったらうれしいのにね
ワンキーで切り替えしたり

そもそも「フォルダを上に集める」と「大文字小文字の区別無し」の設定は
「Z」キーの設定画面（AFXWCFG.EXE）にはなくて
「S」キーのソートメニューに
飛び地のように存在しているのも不思議

しかし
左右、両方の窓は個別に設定できるようになっているから
「好きなほうの窓を使え」という作者の考えなのかもw