ファイル>バックアップ>すべての設定をバックアップ
だと、ほんとに丸々バックアップされるから、再インスコしても問題箇所も再現されちゃう
万が一の予備として取っておくのは損はない
見た目とか設定類は/laf/とか/menus_v2/とか/plugins/とかに散らばってるから、
当たりはつけづらいけど、ファイルサイズの大きいのを一つずつメモ帳で開いて
必要そうなのを自分で判断してコピーを取っといて、再インスコ後に一つずつ戻しては起動
ってのを繰り返して問題点を探してけば良い
org.jdownloader.controlling.filter.LinkFilterSettings.filterlist.json
org.jdownloader.controlling.packagizer.PackagizerSettings.rulelist.json
org.jdownloader.gui.views.linkgrabber.addlinksdialog.LinkgrabberSettings.downloaddestinationhistory.json
org.jdownloader.settings.AccountSettings.accounts.ejs
org.jdownloader.settings.GeneralSettings.json
org.jdownloader.settings.GraphicalUserInterfaceSettings.json
とか身に覚えのあるファイルが沢山見つかると思う
最悪、*.jd2backupをファイル>バックアップ>設定を復元で開けば、原状復帰はできる