適当にやって失敗すると段々面倒になってくるのでフォーラムの手法に忠実に、
復元先の別ディスクに、diskpartでprimary, primary, msr, primaryとレイアウトだけ作って、
セクタ単位で取ったバックアップ（未割り当ては含めない）を使って、（※セクタ単位じゃなくても良いと思う）
「復元するもの」を指定するステージで、「ディスク」にチェックを入れずに各パーティションすべてにチェックした状態で進めて、
次のステージで各パーティションの復元先パーティションを個別に指定するやり方でやったら正確に復元できた。

ただおそらくパーティションGUID（タイプGUIDではない）は保持されるものの（未確認）、
GPTヘッダ内の署名やディスクGUIDはdiskpartでフォーマットしたときに作れらたもので、
バックアップイメージのそれとは異なるので完璧なクローンではないと思われる。
そこまでする必要があるかは別として。