ちなみに、先ほどImageMagickを更新してから久々にwaifu2x-c/c with Batchfile and HTA-GUIを起動して使ってみましたが、
やはり私のPCでは利用できないままなのは変わらないようです。
(起動時にエラーは出るし、ファイルの選択すらできない。)